Immune repertoire in the Picture
Tijdens het project “Immune Repertoire in the Picture” is gebruik gemaakt van next generation sequencing (NGS) technologie om de totale set specifieke herkenningsmoleculen van het immuunsysteem (het immuunrepertoire) in kaart te brengen. Hiervoor is een bioinformatische analyse ontwikkeld om de verkregen sequentie data te visualiseren en te kunnen
interpreteren. Met deze nieuwe technologie zijn nieuwe inzichten verkregen in de vorming van een divers immuunrepertoire. Deze nieuwe inzichten zijn verkregen door het bestuderen van patiënten met aangeboren immunologische aandoeningen, zogenaamde primaire immuundeficiënties. Immuunrepertoire analyses worden nu ingezet voor het bestuderen van andere
immunologische aandoeningen. In het kader van een internationale samenwerking hebben wij een nieuwe primaire immuundeficientie beschreven, waarbij het genetische defect invloed heeft op de vorming van het immuunrepertoire. Dit onderzoek heeft de basis gelegd voor een solide onderzoekslijn op het gebied van primaire immuundeficienties met een focus op defecten in de opbouw van het immuunrepertoire en heeft geresulteerd in een groot internationaal network van
samenwerkingspartners.
Analyssetool
In dit project hebben wij een strategie ontwikkeld voor analyse van het naïeve en het antigeen geselecteerde B-cel repertoire. Hiervoor is een analysetool ontwikkeld die vrij toegankelijk is (https://bioinf-galaxian.erasmusmc.nl/argalaxy). Deze nieuwe strategie is ingezet in diverse onderdelen van het project, waarbij patiënten met een genetisch defect in het immuunsysteem
(primaire immuundeficiënties) zijn bestudeerd.
Producten
Auteur: Van der Burg, M. IJspeert, H. Driessen, G.J.A.
Auteur: van der Burg, M. Weemaes, C.M.R. Cunningham-Rundles, C.
Auteur: IJspeert, H. Van Schouwenburg, P.A. Van der Burg, M.
Auteur: Dalm, V.A.S.H. Van der Burg, M. Van Hagen, P.M.
Auteur: van Gent, D. C. IJspeert, H. van der Burg, M.
Auteur: De Villartay, J. P. Van der Burg, M. Schwarz, K. villa, A.
Auteur: Mathieu, A. L. Verronese, E. Rice, G. I. Fouyssac, F. Bertrand, Y. Picard, C. Chansel, M. Walter, J. E. Notarangelo, L. D. Butte, M. J. Nadeau, K. C. Csomos, K. Chen, D. J. Chen, K. Delgado, A. Rigal, C. Bardin, C. Schuetz, C. Moshous, D. Reumaux, H. Plenat, F. Phan, A. Zabot, M. T. Balme, B. Viel, S. Bienvenu, J. Cochat, P. van der Burg, M. Caux, C. Kemp, E. H. Rouvet, I. Malcus, C. Meritet, J. F. Lim, A. Crow, Y. J. Fabien, N. Menetrier-Caux, C. De Villartay, J. P. Walzer, T. Belot, A.
Magazine: Journal of Allergy and Clinical Immunology
Auteur: IJspeert, Hanna, van Schouwenburg, Pauline A., van Zessen, David, Pico-Knijnenburg, Ingrid, Driessen, Gertjan J., Stubbs, Andrew P., van der Burg, Mirjam
Magazine: Frontiers in Immunology
Auteur: Driessen, Gertjan J., IJspeert, Hanna, Wentink, Marjolein, Yntema, Helger G., van Hagen, P. Martin, van Strien, Arthur, Bucciol, Giorgia, Cogulu, Ozgur, Trip, Margreet, Nillesen, Willy, Peeters, Els A., Pico-Knijnenburg, Ingrid, Barendregt, Barbara H., Rizzi, Marta, van Dongen, Jacques J., Kutukculer, Necil, van der Burg, Mirjam
Magazine: Journal of Allergy and Clinical Immunology
Auteur: Wiekmeijer, Anna-Sophia, Pike-Overzet, Karin, IJspeert, Hanna, Brugman, Martijn H., Wolvers-Tettero, Ingrid L.M., Lankester, Arjan C., Bredius, Robbert G.M., van Dongen, Jacques J.M., Fibbe, Willem E., Langerak, Anton W., van der Burg, Mirjam, Staal, Frank J.T.
Magazine: Journal of Allergy and Clinical Immunology
Auteur: de Haan, N. Reiding, K. R. Driessen, G. van der Burg, M. Wuhrer, M.
Magazine: Journal of Proteome Research
Auteur: Brigida, I. Sauer, A. V. Ferrua, F. Giannelli, S. Scaramuzza, S. Pistoia, V. Castiello, M. C. Barendregt, B. H. Cicalese, M. P. Casiraghi, M. Brombin, C. Puck, J. Muller, K. Notarangelo, L. D. Montin, D. van Montfrans, J. M. Roncarolo, M. G. Traggiai, E. van Dongen, J. J. van der Burg, M. Aiuti, A.
Magazine: Journal of Allergy and Clinical Immunology
Auteur: Cantaert, Tineke, Schickel, Jean-Nicolas, Bannock, Jason M., Ng, Yen-Shing, Massad, Christopher, Delmotte, Fabien R., Yamakawa, Natsuko, Glauzy, Salome, Chamberlain, Nicolas, Kinnunen, Tuure, Menard, Laurence, Lavoie, Aubert, Walter, Jolan E., Notarangelo, Luigi D., Bruneau, Julie, Al-Herz, Waleed, Kilic, Sara Sebnem, Ochs, Hans D., Cunningham-Rundles, Charlotte, van der Burg, Mirjam, Kuijpers, Taco W., Kracker, Sven, Kaneko, Hideo, Sekinaka, Yujin, Nonoyama, Shigeaki, Durandy, Anne, Meffre, Eri
Magazine: Journal of Clinical Investigation
Auteur: Blom, Maartje, Pico-Knijnenburg, Ingrid, Sijne-van Veen, Marja, Boelen, Anita, Bredius, Robbert G.M., van der Burg, Mirjam, Schielen, Peter C.J.I.
Magazine: Journal of Clinical Immunology
Auteur: Wentink, M. W. Lambeck, A. J. van Zelm, M. C. Simons, E. van Dongen, J. J. I. Jspeert H Scholvinck, E. H. van der Burg, M.
Magazine: Clinical Immunology
Auteur: Murray, J. E. van der Burg, M. IJspeert H Carroll, P. Wu, Q. Ochi, T. Leitch, A. Miller, E. S. Kysela, B. Jawad, A. Bottani, A. Brancati, F. Cappa, M. Cormier-Daire, V. Deshpande, C. Faqeih, E. A. Graham, G. E. Ranza, E. Blundell, T. L. Jackson, A. P. Stewart, G. S. Bicknell, L. S.
Magazine: American Journal of Human Genetics
Auteur: Ijspeert H, Warris A, van der Flier M, Reisli I, Keles S, Chishimba S, van Dongen JJ, van Gent DC, van der Burg M
Magazine: Human Mutation
Auteur: IJspeert, H. Wentink, M. van Zessen, D. Driessen, G. J. Dalm, V. A. van Hagen, M. P. Pico-Knijnenburg, I. Simons, E. J. van Dongen, J. J. Stubbs, A. P. van der Burg, M.
Magazine: Frontiers in Immunology
Auteur: IJspeert, H. Rozmus, J. Schwarz, K. Warren, R. L. van Zessen, D. Holt, R. A. Pico-Knijnenburg, I. Simons, E. Jerchel, I. Wawer, A. Lorenz, M. Patiroglu, T. Akar, H. H. Leite, R. Verkaik, N. S. Stubbs, A. P. van Gent, D. C. van Dongen, J. J. van der Burg, M.
Magazine: Blood
Auteur: Cantaert, T. Schickel, J. N. Bannock, J. M. Ng, Y. S. Massad, C. Delmotte, F. R. Yamakawa, N. Glauzy, S. Chamberlain, N. Kinnunen, T. Menard, L. Lavoie, A. Walter, J. E. Notarangelo, L. D. Bruneau, J. Al-Herz, W. Kilic, S. S. Ochs, H. D. Cunningham-Rundles, C. van der Burg, M. Kuijpers, T. W. Kracker, S. Kaneko, H. Sekinaka, Y. Nonoyama, S. Durandy, A. Meffre, E.
Magazine: Journal of Clinical Investigation
Auteur: Anzilotti, C. Kienzler, A. K. Lopez-Granados, E. Gooding, S. Davies, B. Pandit, H. Lucas, M. Price, A. Littlewood, T. van der Burg, M. Patel, S. Y. Chapel, H.
Magazine: Journal of Allergy and Clinical Immunology
Auteur: Griffith, L. M. Cowan, M. J. Notarangelo, L. D. Kohn, D. B. Puck, J. M. Pai, S. Y. Ballard, B. Bauer, S. C. Bleesing, J. J. Boyle, M. Brower, A. Buckley, R. H. van der Burg, M. Burroughs, L. M. Candotti, F. Cant, A. J. Chatila, T. Cunningham-Rundles, C. Dinauer, M. C. Dvorak, C. C. Filipovich, A. H. Fleisher, T. A. Bobby Gaspar, H. Gungor, T. Haddad, E. Hovermale, E. Huang, F. Hurley, A. Hurley, M. Iyengar, S. Kang, E. M. Logan, B. R. Long-Boyle, J. R. Malech, H. L. McGhee, S. A. Modell, F. Mode
Magazine: Journal of Allergy and Clinical Immunology
Auteur: Wiekmeijer, A. S. Pike-Overzet, K. IJspeert, H. Brugman, M. H. Wolvers-Tettero, I. L. Lankester, A. C. Bredius, R. G. van Dongen, J. J. Fibbe, W. E. Langerak, A. W. van der Burg, M. Staal, F. J.
Magazine: J Allergy Clin Immunol
Auteur: de Jong, Britt G, IJspeert, Hanna, Marques, Lemelinda, van der Burg, Mirjam, van Dongen, Jacques JM, Loos, Bruno G, van Zelm, Menno C
Magazine: Immunology and Cell Biology
Auteur: Wentink, Marjolein, Dalm, Virgil, Lankester, Arjan C., van Schouwenburg, Pauline A., Schölvinck, Liesbeth, Kalina, Tomas, Zachova, Radana, Sediva, Anna, Lambeck, Annechien, Pico-Knijnenburg, Ingrid, van Dongen, Jacques J.M., Pac, Malgorzata, Bernatowska, Ewa, van Hagen, Martin, Driessen, Gertjan, van der Burg, Mirjam
Magazine: Clinical Immunology
Auteur: Akar, H. H. Patiroglu, T. Hershfield, M. van der Burg, M.
Magazine: Central European Journal of Immunology
Auteur: Janda, A. Schwarz, K. van der Burg, M. Vach, W. Ijspeert, H. Lorenz, M. R. Elgizouli, M. Pieper, K. Fisch, P. Hagel, J. Lorenzetti, R. Seidl, M. Roesler, J. Hauck, F. Traggiai, E. Speckmann, C. Rensing-Ehl, A. Ehl, S. Eibel, H. Rizzi, M.
Magazine: Blood
Auteur: Alkhairy, O. K. Perez-Becker, R. Driessen, G. J. Abolhassani, H. van Montfrans, J. Borte, S. Choo, S. Wang, N. Tesselaar, K. Fang, M. Bienemann, K. Boztug, K. Daneva, A. Mechinaud, F. Wiesel, T. Becker, C. Duckers, G. Siepermann, K. van Zelm, M. C. Rezaei, N. van der Burg, M. Aghamohammadi, A. Seidel, M. G. Niehues, T. Hammarstrom, L.
Magazine: Journal of Allergy and Clinical Immunology
Auteur: Bjorkman, A. Du, L. Felgentreff, K. Rosner, C. Pankaj Kamdar, R. Kokaraki, G. Matsumoto, Y. Davies, E. G. van der Burg, M. Notarangelo, L. D. Hammarstrom, L. Pan-Hammarstrom, Q.
Magazine: Journal of Immunology
Auteur: Yu, X. Almeida, J. R. Darko, S. van der Burg, M. Deravin, S. S. Malech, H. Gennery, A. Chinn, I. Markert, M. L. Douek, D. C. Milner, J. D.
Magazine: Journal of Allergy and Clinical Immunology
Auteur: Verstegen, R. H. Driessen, G. J. Bartol, S. J. van Noesel, C. J. Boon, L. van der Burg, M. van Dongen, J. J. de Vries, E. van Zelm, M. C.
Magazine: Journal of Allergy and Clinical Immunology
Auteur: Mitsuiki, N. Yang, X. Bartol, S. J. W. Grosserichter-Wagener, C. Kosaka, Y. Takada, H. Imai, K. Kanegane, H. Mizutani, S. van der Burg, M. van Zelm, M. C. Ohara, O. Morio, T.
Magazine: International Journal of Hematology
Auteur: Berkowska, M. A. Heeringa, J. J. Hajdarbegovic, E. van der Burg, M. Thio, H. B. van Hagen, P. M. Boon, L. Orfao, A. van Dongen, J. J. van Zelm, M. C.
Magazine: Journal of Allergy and Clinical Immunology
Auteur: Moorhouse, M. J. van Zessen, D. IJspeert H Hiltemann, S. Horsman, S. van der Spek, P. J. van der Burg, M. Stubbs, A. P.
Magazine: BMC Immunology
Auteur: Unger, Susanne, Seidl, Maximilian, van Schouwenburg, Pauline, Rakhmanov, Mirzokhid, Bulashevska, Alla, Frede, Natalie, Grimbacher, Bodo, Pfeiffer, Jens, Schrenk, Klaudia, Munoz, Luis, Hanitsch, Leif, Stumpf, Ina, Kaiser, Fabian, Hausmann, Oliver, Kollert, Florian, Goldacker, Sigune, van der Burg, Mirjam, Keller, Baerbel, Warnatz, Klaus
Magazine: Journal of Allergy and Clinical Immunology
Auteur: Wong, M. T. Lambeck, A. J. van der Burg, M. la Bastide-van Gemert, S. Hogendorf, L. A. van Ravenswaaij-Arts, C. M. Scholvinck, E. H.
Magazine: PLoS ONE
Auteur: Gokturk, B. Keles, S. Kirac, M. Artac, H. Tokgoz, H. Guner, S. N. Caliskan, U. Caliskaner, Z. van der Burg, M. van Dongen, J. Morgan, N. V. Reisli, I.
Magazine: Scandinavian Journal of Immunology
Auteur: Driessen GJ, Dalm VA, van Hagen PM, Grashoff HA, Hartwig NG, van Rossum A, Warris A, de Vries E, Barendregt BH, Pico I, Posthumus S, van Zelm MC, van Dongen JJ, van der Burg M
Magazine: Haematologica
Auteur: Felgentreff, K. Lee, Y. N. Frugoni, F. Du, L. van der Burg, M. Giliani, S. Tezcan, I. Reisli, I. Mejstrikova, E. de Villartay, J. P. Sleckman, B. P. Manis, J. Notarangelo, L. D.
Magazine: Journal of Allergy and Clinical Immunology
Auteur: Vollebregt, M. M. Malfroot, A. De Raedemaecker, M. van der Burg, M. van der Werff Ten Bosch, J. E.
Magazine: Case Reports in Immunology
Auteur: Genovese, P. Schiroli, G. Escobar, G. Di Tomaso, T. Firrito, C. Calabria, A. Moi, D. Mazzieri, R. Bonini, C. Holmes, M. C. Gregory, P. D. van der Burg, M. Gentner, B. Montini, E. Lombardo, A. Naldini, L.
Magazine: Nature
Auteur: Meijers, Ruud W. J., Dzierzanowska-Fangrat, Katarzyna, Zborowska, Magdalena, Solarska, Iwona, Tielemans, Dennis, van Turnhout, Bob A. C., Driessen, Gertjan, van der Burg, Mirjam, van Dongen, Jacques J. M., Chrzanowska, Krystyna H., Langerak, Anton W.
Magazine: Journal of Clinical Immunology
Auteur: Overwater, E. Smulders, Y. van der Burg, M. Lombardi, M. P. Meijers-Heijboer, H. E. Kuijpers, T. W. Houweling, A. C.
Magazine: European Journal of Pediatrics
Auteur: Patiroglu, T. Akar, H. H. van der Burg, M. Kontas, O.
Magazine: Clinical Immunology
Auteur: Castiello, M. C. Scaramuzza, S. Pala, F. Ferrua, F. Uva, P. Brigida, I. Sereni, L. van der Burg, M. Ottaviano, G. Albert, M. H. Grazia Roncarolo, M. Naldini, L. Aiuti, A. Villa, A. Bosticardo, M.
Magazine: Journal of Allergy and Clinical Immunology
Auteur: Nijman, I. J. van Montfrans, J. M. Hoogstraat, M. Boes, M. L. van de Corput, L. Renner, E. D. van Zon, P. van Lieshout, S. Elferink, M. G. van der Burg, M. Vermont, C. L. van der Zwaag, B. Janson, E. Cuppen, E. Ploos van Amstel, J. K. van Gijn, M. E.
Magazine: Journal of Allergy and Clinical Immunology
Auteur: Rother, Magdalena B., Jensen, Kristin, van der Burg, Mirjam, van de Bovenkamp, Fleur S., Kroek, Roel, van IJcken, Wilfred F. J., van der Velden, Vincent H. J., Cupedo, Tom, Olstad, Ole K., van Dongen, Jacques J. M., van Zelm, Menno C.
Magazine: Scientific Reports
Auteur: van der Spek, J. Groenwold, R. H. van der Burg, M. van Montfrans, J. M.
Magazine: Journal of Clinical Immunology
Auteur: Gudmundsdottir, Judith, Lundqvist, Christina, Ijspeert, Hanna, van der Slik, Eva, Óskarsdóttir, Sólveig, Lindgren, Susanne, Lundberg, Vanja, Berglund, Martin, Lingman-Framme, Jenny, Telemo, Esbjörn, van der Burg, Mirjam, Ekwall, Olov
Magazine: Journal of Allergy and Clinical Immunology
Auteur: Björkman, Andrea, Du, Likun, van der Burg, Mirjam, Cormier-Daire, Valerie, Borck, Guntram, Pié, Juan, Anderlid, Britt-Marie, Hammarström, Lennart, Ström, Lena, de Villartay, Jean-Pierre, Kipling, David, Dunn Walters, Deborah, Pan-Hammarström, Qiang
Magazine: Journal of Allergy and Clinical Immunology
Auteur: Petersen, S. H. Sendel, A. van der Burg, M. Westerberg, L. S.
Magazine: Frontiers in Immunology
Auteur: de Pagter, A. P. Bredius, R. G. Kuijpers, T. W. Tramper, J. van der Burg, M. van Montfrans, J. Driessen, G. J. Dutch Working Party for, Immunodeficiencies
Magazine: European Journal of Pediatrics
Auteur: Patiroglu, T. Akar, H. H. Van Der Burg, M.
Magazine: Acta Microbiologica et Immunologica Hungarica
Auteur: Akar, H. H. Patiroglu, T. Akyildiz, B. N. Tekerek, N. U. Dogan, M. S. Doganay, S. van der Burg, M. Dusunsel, R.
Magazine: Clinical Immunology
Auteur: IJspeert, Hanna, van Schouwenburg, Pauline A., van Zessen, David, Pico-Knijnenburg, Ingrid, Stubbs, Andrew P., van der Burg, Mirjam
Magazine: Journal of Immunology
Auteur: van der Burg, M. van Zelm, M. C.
Magazine: Frontiers in Immunology
Auteur: de Haan, Noortje, Reiding, Karli R., Driessen, Gertjan, van der Burg, Mirjam, Wuhrer, Manfred
Magazine: Journal of Proteome Research
Auteur: Kuijpers TW, van Leeuwen EM, Barendregt BH, Klarenbeek P, aan de Kerk DJ, Baars PA, Jansen MH, de Vries N, van Lier RA, van der Burg M
Magazine: Haematologica
Auteur: van Zelm, M. C. Bartol, S. J. Driessen, G. J. Mascart, F. Reisli, I. Franco, J. L. Wolska-Kusnierz, B. Kanegane, H. Boon, L. van Dongen, J. J. van der Burg, M.
Magazine: Journal of Allergy and Clinical Immunology
Auteur: van de Bovenkamp, Fleur S., Derksen, Ninotska I. L., Ooijevaar-de Heer, Pleuni, van Schie, Karin A., Kruithof, Simone, Berkowska, Magdalena A., van der Schoot, C. Ellen, IJspeert, Hanna, van der Burg, Mirjam, Gils, Ann, Hafkenscheid, Lise, Toes, René E. M., Rombouts, Yoann, Plomp, Rosina, Wuhrer, Manfred, van Ham, S. Marieke, Vidarsson, Gestur, Rispens, Theo
Magazine: Proceedings of the National Academy of Sciences USA
Auteur: IJspeert, H., Rozmus, J., Schwarz, K., Warren, R. L., van Zessen, D., Holt, R. A., Pico-Knijnenburg, I., Simons, E., Jerchel, I., Wawer, A., Lorenz, M., Pat ro lu, T., Akar, H. H., Leite, R., Verkaik, N. S., Stubbs, A. P., van Gent, D. C., van Dongen, J. J. M., van der Burg, M.
Magazine: BLOOD
Auteur: IJspeert, H. Driessen, G. J. Moorhouse, M. J. Hartwig, N. G. Wolska-Kusnierz, B. Kalwak, K. Pituch-Noworolska, A. Kondratenko, I. van Montfrans, J. M. Mejstrikova, E. Lankester, A. C. Langerak, A. W. van Gent, D. C. Stubbs, A. P. van Dongen, J. J. van der Burg, M.
Magazine: Journal of Allergy and Clinical Immunology
Auteur: Driessen GJ, Ijspeert H, Weemaes CM, Haraldsson A, Trip M, Warris A, van der Flier M, Wulffraat N, Verhagen MM, Taylor MA, van Zelm MC, van Dongen JJ, van Deuren M, van der Burg M
Magazine: Journal of Allergy and Clinical Immunology
Auteur: Castiello, M. C. Bosticardo, M. Pala, F. Catucci, M. Chamberlain, N. van Zelm, M. C. Driessen, G. J. Pac, M. Bernatowska, E. Scaramuzza, S. Aiuti, A. Sauer, A. V. Traggiai, E. Meffre, E. Villa, A. van der Burg, M.
Magazine: Journal of Autoimmunity
Auteur: van den Heuvel, D. Driessen, G. J. Berkowska, M. A. van der Burg, M. Langerak, A. W. Zhao, D. Charif, H. Hartwig, N. G. van Rossum, A. M. Fraaij, P. L. van Dongen, J. J. van Zelm, M. C.
Magazine: AIDS
Auteur: Janda, A., Schwarz, K., van der Burg, M., Vach, W., Ijspeert, H., Lorenz, M. R., Elgizouli, M., Pieper, K., Fisch, P., Hagel, J., Lorenzetti, R., Seidl, M., Roesler, J., Hauck, F., Traggiai, E., Speckmann, C., Rensing-Ehl, A., Ehl, S., Eibel, H., Rizzi, M.
Magazine: BLOOD
Auteur: Schatorje, E. J. Driessen, G. J. van Hout, R. W. van der Burg, M. de Vries, E.
Magazine: Clinical and Experimental Immunology
Auteur: Felgentreff, K. Du, L. Weinacht, K. G. Dobbs, K. Bartish, M. Giliani, S. Schlaeger, T. DeVine, A. Schambach, A. Woodbine, L. J. Davies, G. Baxi, S. N. van der Burg, M. Bleesing, J. Gennery, A. Manis, J. Pan-Hammarstrom, Q. Notarangelo, L. D.
Magazine: Proceedings of the National Academy of Sciences
Auteur: Carey, Alison J., Hope, Jennifer L., Mueller, Yvonne M., Fike, Adam J., Kumova, Ogan K., van Zessen, David B. H., Steegers, Eric A. P., van der Burg, Mirjam, Katsikis, Peter D.
Magazine: Frontiers in Immunology
Auteur: Rother, M. B. Jensen, K. van der Burg, M. van de Bovenkamp, F. S. Kroek, R. van, IJcken W. F. van der Velden, V. H. Cupedo, T. Olstad, O. K. van Dongen, J. J. van Zelm, M. C.
Magazine: Scientific Reports